加熱磁力攪拌器的工作原理是利用磁性物質同性相斥的特性，通過不斷變換基座的兩端的極性來推動磁性攪拌棒轉動。
磁力攪拌器由內外兩個磁鋼，中間有隔離套隔開，靠電機驅動后內外磁鋼產生磁耦合達到傳動的目的。應用在泵類多，磁力泵可以達到*無泄漏、并且能量轉化高效。和下磁力攪拌器對應的是上磁力攪拌器，由于仍然沒有*去除軸封帶來的風險，應用領域很局限。由于攪拌是一門實驗科學，攪拌器的放大是與工藝過程有關的復雜問題，至今只能通過逐級經驗放大，根據取得的放大依據，外推至工業規模。
目前磁力攪拌器主要依靠制造企業的以常見緩沖液為主要模式溶液的模擬試驗、并在此基礎上做的定型和放大，所有定制型都是在標準型號基礎上的改進，例如材料定制、功率定制、槳葉形狀定制等等。加熱磁力攪拌器轉頭的設計、轉頭與軸承的銜接、轉頭與軸承之間的間隙直接關系到CIP/SIP的效果，一般轉頭越開放越好。
轉頭的材料，是316L不銹鋼，內包永磁鐵，軸承材料常用的是碳化硅陶瓷，*惰性，適合pH1~14，熱膨脹小，在有水潤滑的情況下，可以耐受高達5000~6000rpm的轉速不磨損，由于工作狀態下的磁力攪拌器，是*浸在溶液下，潤滑槽的存在可使溶液通過，從而使整個摩擦界面始終被水膜覆蓋，在旋轉時，摩擦力非常小，不會出現可以檢測到的顆粒，對產品不會構成威脅。
安裝的部位往往位于罐底斜底部，根據制造商的安裝指南進行組裝，位置和人孔/手孔正對著罐底部，避開罐底閥的安裝位置，之所以這樣設計，可以形成渦流和湍流，從而達到更佳的攪拌效果，專家已經作過這方面的實驗，有具體的參數可供參考，當然這也和罐體的高徑比、溶液性質、粘度、攪拌轉速、攪拌器的配型等因素有關。
攪拌器的陽軸承上有定子或剪切內刃，轉頭是動子或剪切外刃，轉頭、陽軸承及焊接板的上部是*與料液相接觸的。當轉頭/動子運轉時，固體顆?；蛘咭旱卧趧幼颖患铀?，和定子發生劇烈碰撞從而被減速，再被加速再碰撞或者顆粒與顆粒之間發生劇烈碰撞，從而使顆粒物由大變小，粉碎，形成均一的小粒徑。
